La Federación Nacional de Cafeteros administra varios programas y proyectos con las agencias de cooperación internacional de varios países y otras organizaciones con recursos oficiales. Sus acciones contribuyen al mejoramiento de los indicadores de la comunidad cafetera en línea con los Objetivos de Desarrollo del Milenio, los planes y programas nacionales y regionales y las propuestas de valor de nuestro plan estratégico. Estos proyectos se ejecutan dentro de un marco de eficiencia, eficacia y transparencia en la rendición de cuentas. Cuentan con el apoyo técnico y financiero de otras entidades a nivel  local que permiten ampliar los objetivos propuestos.

Los programas y proyectos actuales son:

• Agronegocios y PyMes - USAID

• Modelos Innovadores - Jóvenes Caficultores

• Familia Guardabosques

• Programa Forestal

• Proyecto Acceso a mercados de cafés certificados UTZ

• Proyecto de Educación para el Arraigo, Estabilidad y Bienestar de la Comunidad Rural del Tolima

• Fortalecimiento del Liderazgo, Economía Campesina y Biodiversidad en el Corredor Alto Andino 

• Proyecto Implementación del código común 4C en la zona cafetera del departamento de Antioquia

• Mejora, Rendimiento y Producción de Café Orgánico para la Sostenibilidad de la Comunidad Indígena Páez en Cauca

• Adopción Código de Conducta de la Comunidad Cafetera (4C) y certificación RainForest Alliance (RFA) en Santander